Independientemente del tipo, todo el chocolate debe ser almacenado en un lugar fresco y de baja humedad (seco), lejos de la luz solar directa. Lo mejor sería sellarlo en un contenedor hermético, porque, como dijo ElendiTheTall, la manteca de cacao que contiene absorberá los sabores.
El chocolate negro durará años. El chocolate blanco y el de leche durarán mucho menos tiempo (unos pocos meses), debido a su contenido en leche.
El chocolate mal almacenado desarrollará una floración, que se muestra como un rayado o mancha blanca o gris en la superficie. El manchado o rayado es la grasa de la manteca de cacao que se separa y es un signo de que el chocolate ha perdido su temperamento. Este tipo de chocolate sigue siendo adecuado para cualquier aplicación en la que el chocolate se derrita completamente (la mayoría de las horneadas). Incluso puede utilizarse como chocolate base (sin semillas) para templar con el método de la semilla, pero no debe utilizarse para la fabricación de otros dulces.