El vinagre es ácido acético. Se fabrica cuando la levadura se come el almidón y produce alcohol que luego es consumido por la bacteria acetobacter para fabricar ácido acético.
Me cuesta imaginar que un pan huela fuertemente a vinagre, pero todos los ingredientes están ahí. El pan fue fermentado por la levadura y sí contenía alcohol antes de ser horneado. Si el pan estaba poco horneado y recogió las bacterias adecuadas, podría ser una traza de vinagre.
Otras opciones son que el pan haya cogido una bacteria normal parecida a la de la masa madre y que sólo huela agrio sin tener ácido acético real.
Cualquiera de estas opciones requeriría que el pan estuviera poco cocido o muy húmedo.
Cualquier cosa más allá de esto sería una conjetura.
¿Tal vez el pan fue horneado con vinagre?